А.А. Карачёва
Красноярская государственная медицинская академия,
«Сибирское медицинское обозрение»
В течение 30 лет человек использует метод генных переносов. Технология генной инженерии позволяет совершать быструю и, более того, направленную генетическую модификацию организмов, включая растения и животных.
Селекционная наука обеспечила человечество новыми сортами растений, породами животных, но эти процессы очень длительны и охватывают годы и десятилетия. Очень много подводных камней на пути селекционера, что связано с нескрещиваемостью организмов, непроявлением гетерозиса в качестве ожидаемого результата и т.д. Задачи ускорения процессов по созданию желаемого высокопродуктивного сорта или породы разрешимы только за счет возможности генно-инженерных введений нужных комбинаций аллелей в уже существующие производственные сорта. Те сельскохозяйственные растения, в которых ген определенного качества (допустим, карликовости) введен в организм, принципиально не будут отличаться от карликового растения, выведенного методом длительной селекции, то есть значительно ускоряется процесс получения организмов с требуемыми качествами. С помощью современных методов можно достаточно легко обнаружить в геноме чужие гены, внедренные туда извне путем горизонтального переноса. Исследуя нуклеотидный состав ДНК и частоту встречаемости определенных кодонов, узнают, какой из фрагментов генома чужой, а какой — «родной». Так находят вкрапления в геном чужих сегментов ДНК, попавших в организм относительно недавно (естественно, в эволюционном масштабе). Со временем за счет геномных перестроек и мутаций происходит как бы «приобщение», унификация чужих генов, и они перестают отличаться от генов «родных». Кстати, по степени «чужеродности» фрагмента можно рассчитать эволюционный момент его появления в геноме.
Генетические заболевания сегодня – что изменилось?
Какова же доля генов-иммигрантов в уже расшифрованных геномах? Например, у популярной кишечной палочки около 16% генома, по-видимому, получено сравнительно недавно — около 100 млн. лет назад. У ряда патогенных бактерий доля чужих генов колеблется от 1 до 8%, а у некоторых свободноживущих бактерий и археобактерий она может достигать 20%. В геноме эукариот также немало генов бактериального или архейного происхождения. В геномах бактерий, в свою очередь, встречаются отдельные гены, типичные для животных или растений. Вообще в большинстве случаев трудно определить, какие конкретно организмы были донорами, поскольку обнаруженные в геномах «чужеродные» вставки могли попасть туда через цепочку промежуточных хозяев. Важен результат: геномы практически всех организмов мозаичны, что подтверждает факт активного генного переноса, в котором в ходе эволюции участвовали самые разные группы организмов. Согласно наиболее популярной гипотезе происхождения эукариот, сам их геном сформировался при слиянии клетки археи и бактерий, чем и объясняется наличие в нем «древних» генов. Кроме того, считается, что эукариотические внутриклеточные органеллы, имеющие свой наследственный материал, у эукариотов возникли путем эндосимбиоза с бактериями. В ходе этого процесса происходил и горизонтальный перенос генов из бактериальных предшественников митохондрий и хлоропластов в ядерный геном эукариот, что также внесло существенный вклад в мозаичное строение эукариотических геномов. Реже всего переносятся гены «домашнего хозяйства», то есть гены многокомпонентных информационных систем, ответственных за копирование и передачу наследственной информации, а также за жизненно важные энергетические процессы. А вот гены, контролирующие клеточные структуры, особенности метаболизма, транспортные пути, переносятся относительно легко. В составе приобретенных сегментов ДНК часто встречаются плазмиды, провирусы, гены белков, облегчающих интеграцию чужеродного генетического материала.
Сегодня исследованы функции лишь 30-40% генов в составе геномов модельных организмов. Ученым может быть известен сам ген и даже понятно, как он построен и где расположен. А вот что он делает в клетке… Именно эти, малоизученные «серые кардиналы», для которых нет ортологов в организме-реципиенте, переносятся чаще всего и могут играть важнейшую роль в его приспособлении к изменившимся условиям среды. При этом многие организмы исполняют в горизонтальных переносах роль «проточных емкостей»: какие-то гены приходят, трансформируются, какие-то уходят или деградируют, а в результате баланса этих процессов поддерживается определенный размер генома.
В.К. Шумный [6,7] в статье «Природа была первым генным инженером» указывает, что благодаря прогрессу в области молекулярной генетики и стремительному накоплению данных о структуре геномов микроорганизмов, растений и животных стало понятно, что обмен генами между организмами разных систематических категорий — достаточно обычное явление, играющее определенную роль в эволюции. Подробную информацию о роли горизонтального переноса генов в эволюции можно почерпнуть из статьи СВ. Шестакова «Трансгенные родственники». Открыты грандиозные перспективы получения растений, животных и микроорганизмов с улучшенными или новыми признаками, то есть ознаменовало совершенно новый этап в селекции.
Горизонтальный перенос генов наиболее актуален для микробного мира. У этих организмов отсутствует свойственный высшим формам половой процесс. В связи с этим горизонтальный перенос у них был и является одним из главных способов увеличения и модификации генетической информации. В этом смысле для архей и бактерий вообще не слишком подходит классическое определение «вида» — из-за высокой пластичности геномов и наличия большого «обменного генетического фонда». По мере усложнения организмов в процессе вертикальной эволюции возникали и совершенствовались барьеры, препятствующие горизонтальным генным переносам. Развивались механизмы, обеспечивающие автономность и стабильность собственных генов. Частота горизонтальных переносов у высших организмов, обладающих сложным генетическим аппаратом и системами репродуктивной изоляции, должна была автоматически падать: вероятность интеграции чужих генов в геном высших организмов крайне невелика. Этот фактор должен успокоить любителей лакомиться трансгенными грушами и другими плодами генной инженерии. В ходе эволюции возникали самые неожиданные геномные перекресты, связующие ветвящееся дерево.
Какие выгоды может дать биологическому виду естественный трансгенез?
Их немало. Можно получить совершенно новый ген, новое качество, или приобрести пара-логичный (функционально похожий на свой собственный) ген и тем самым увеличить разнообразие белков в клетке. Есть шанс обзавестись ортологом из эволюционно далекой группы и таким способом улучшить какую-нибудь функцию, изменить регуляцию клеточных процессов. Если организм благодаря трансгенезу обзаводится способностью усваивать новый пищевой субстрат, то ему «светит» и «новое место» в жизни. Можно приобрести устойчивость к неблагоприятным факторам среды, токсинам, патогенам — именно таким способом в микробном мире стремительно передается так удручающая нас устойчивость к антибиотикам.
Допустим, что приобретенные гены оказываются функциональными дубликатами уже имеющихся. Тоже не беда! Страховка на случай повреждения «родного» гена никогда не помешает. Причем вовсе не обязательно, чтобы новый ген сохранился в неизменном автономном виде. Путем перекомбинаций и слияния функционально различающихся участков гена могут образовываться совершенно новые гены и, соответственно, новые белки с разными клеточными функциями.
Таким образом, горизонтальный перенос генов, радикально меняя свойства организма, значительно расширяет диапазон изменчивости, необходимой для действия факторов естественного отбора. Приобретение «чужих» генов в ряде случаев меняет направление эволюции вида, дает толчок образованию новой популяции, способной вытеснить предшествующий вид. Роль этого фактора как источника быстрых эволюционных изменений особенно велика в периоды глобальных кризисов и катастроф.
Постепенное накопление мутаций, а затем импульсное, скачкообразное изменение — вот в чем суть горизонтального переноса генов как одной из движущих сил эволюционного процесса.
В последние 30 лет человек успешно использует методы генных переносов. Технология генной инженерии позволяет совершать быструю и, более того, направленную генетическую модификацию разных организмов, включая растения и животных.
Особую роль в этом направлении сыграло развитие современной промышленной микробиологии. Достижения молекулярной генетики в последние десять лет открыли большие перспективы в области теоретических познаний, а также практического использования в медицине, сельском хозяйстве, промышленности и быту.
Трансгенез у растительных организмов, являясь прежде всего научной проблемой, в то же время имеет и практическое применение. В частности, клонирование генов, создание генно-инженерных конструкций, анализ экспрессии генов, проблема сайленсинга — это только небольшая часть теоретических наработок в этой области. Естественным является интерес ученых, медиков а также большей части населения к практическим аспектам трансгенеза. В связи с тем, что на сегодня получены трансгенные растения люцерны с геном интерферона человека, растения моркови с генами интерлейкинов, картофеля с геном неспецифической бактериальной ну-клеазы, табака с повышенным содержанием пролина, интерес к практическому использованию результатов этих исследовании очень высок. Говоря о трансгенных организмах вообще и растениях в частности, следует указать, что эти наработки состоялись благодаря супермощным технологиям в молекулярной генетике, однако в этой области еще много нерешенных проблем. Начиная с 80-х годов прошлого века спектр продуктов микробного синтеза существенно расширился за счет внедрения в область микробной биотехнологии методов генной инженерии. Полученные таким способом биологически активные препараты используются в качестве пищевых добавок не только для животных, но и для человека. Принципиально изменилась схема селекции промышленных микроорганизмов, основанная не на поиске эффективных штаммов-продуцентов, а на введении «нужных» генов в организм бактерий, что обеспечивает эффективный синтез целевого продукта.
Со страниц периодической печати, с экранов телевизоров население страны, да и всего мира, получает поток информации о дискуссиях вокруг генетически модифицированных организмов, что связано, в основном, с использованием трансгенных растений и животных в различных целях. Прежде всего это получение медицинских препаратов, биологически активных веществ и генетически модифицированных продуктов питания. Во всем мире на сегодня получено более ста видов трансгенных форм растений, для выращивания которых использовано более 60 миллионов гектаров посевных площадей. Продовольственный рынок ежегодно получает миллионы тонн зерна трансгенных кукурузы, рапса и др. Эти сельскохозяйственные культуры являются компонентами многих продуктов питания, которые попадают и на рынок России. Не всегда, к сожалению, такие продукты имеют маркировку с указанием наличия в их составе генетически модифицированных организмов (ГМО). Каждый из нас уже многократно употребил трансгенную продукцию вместе с пищей и лекарствами. В США, например, уже более 70% продуктов питания содержат ингредиенты, полученные из трансгенных организмов. В России эта доля пока невелика, но будет неуклонно возрастать.
Острые проблемы демографического развития России
У этого процесса есть свои минусы и плюсы. При той демографической ситуации, которая складывается на планете, в принципе невозможно обойтись без активного использования генетически модифицированных организмов. Ведь ресурсы естественной селекции ограничены. Следует особо подчеркнуть, что «чужие» гены, попадающие в нашу пищу из трансгенных растений, не включаются в геном человека через механизмы горизонтального переноса и поэтому не представляют никакой реальной опасности. Однако надо отдавать себе отчет в том, что появление в природе организмов, представляющих собой продукт трансгенеза, может, как и большинство других технологических достижений, влиять на функционирование экологических систем, темпы и направления биологической эволюции. Поэтому нужен жесткий контроль за работами в области генной инженерии. Необходимо тщательное тестирование на биобезопасность, которое сейчас и проходят все новые формы трансгенных организмов. Конечно, жаль, что у человечества, в отличие от природы-матушки, нет возможности в течение пары миллионов лет оценить последствия этих генетических экспериментов. Что ж делать? Просто к вере в прогресс нужно прибавить чувство ответственности за будущее биосферы. Между эволюционным феноменом — горизонтальным переносом генов и трансгенезом, осуществляемым в лабораториях, существует очевидное сходство. И в том, и в другом случае происходит перенос и экспрессия (работа) чужеродной генетической информации в геноме организма-донора. Только в одном планирование эксперимента и оценка его последствий производится человеком, в другом арбитром служит естественный отбор.
Человек перешел на оседлый образ жизни и занялся культивированием растений и разведением животных примерно 10-12 тысяч лет тому назад. На первых порах в его распоряжении были только дикие виды растений и животных, то есть продукты естественной эволюции. На этом материале человек стал проводить селекцию (отбор), что, по образному выражению Н.И. Вавилова, тоже является эволюцией, но уже направляемой волей человека и для своих целей. То, что мы имеем сегодня в виде сортов культурных растений и пород животных, имеет мало общего как с дикими предками, как и с современными дикими «собратьями». Более того, некоторые виды растений и животных встречаются исключительно в виде культурных форм, а их родоначальники канули в Лету. За время 10-тысячелетней селекции произошла колоссальная реорганизация структуры и функции наследственного материала этих организмов, без сомнения, просто не сравнимая с итогами генно-инженерной деятельности, которая осуществлялась лишь в течение последних 30-40 лет. Единственное, что добавил экспериментатор в достаточно «привычном» для человечества деле преобразования геномов, — раздвинул и ослабил таксономические ограничения на перенос генетического материала. Создание новых форм организмов стало возможным не только путем отбора полезных мутаций и близкородственных скрещиваний, но и «прямым» переносом нужных генов между представителями разных родов, семейств, типов и даже царств! Создание и использование трансгенных, или (как их называют в СМИ) генетически модифицированных, организмов (ГМО) вызвало в обществе бурные и до сих пор не прекращающиеся дискуссии. Особенно это относится к трансгенным растениям, которые все чаще используются в продуктах питания. Противники, зачастую мало сведущие в этой области, утверждают об опасности потребления генетически модифицированных растений человеком.
Так все же «есть» или «не есть» чужеродную ДНК?
В связи с этим вопросом вспомним некоторые простые, но редко «востребуемые» биологические аксиомы. Первое: по своей природе человек, как и все животные и многие микроорганизмы, является гетеротрофом. Это значит, что мы, в отличие от растений-автотрофов, не можем обходиться водой, солнечной энергией и углекислым газом, нам подавай готовые органические вещества! А органика эта, по большей части, заключена в клетках и тканях конкретных организмов, то есть попадает на наш стол в виде мяса, овощей, яиц и тому подобной гастрономии.
Любая живая клетка содержит в себе наследственный материал в виде ДНК, поэтому около 0,1% от веса потребляемой нами пищи приходится на чужеродную ДНК. Тысячелетиями в пищевой рацион человека входили представители всех живых царств, начиная от бактерий и грибов. Помимо ДНК зверей, птиц и рыб, мы не отказываемся от растительной (часто предпочитая ее в сыром виде) и ДНК микроорганизмов (начиная от йогурта и заканчивая пивом!). Однако наши встречи с нуклеиновыми кислотами не ограничиваются «кулинарными» рамками: мы постоянно сталкиваемся с огромным количеством наследственного материала разнообразных вирусов, бактерий, простейших и грибов — наших друзей-симбионтов, и паразитов — возбудителей болезней. Бактериальная ДНК попадает к нам вместе с вдыхаемым воздухом и пылью. Наша кожа, слизистая пищеварительного тракта и половых путей, наш кишечник заселены мириадами микроорганизмов — до 6 килограммов на человека! — с которыми мы, по большей части, мирно и с пользой сосуществуем. Более того, наши «квартиранты», как уже упоминалось, могут при этом спокойно обмениваться наследственным материалом — например, передавать ген устойчивости к антибиотику, занимаясь «законным» естественным трансгенезом. А что уж говорить о вирусах, для которых встроить свой наследственный материал в наш геном — обычное дело!
Нужно ли бояться чужой ДНК вообще и трансгенной — в частности?
Высшие организмы, особенно животные и человек, в процессе эволюции сформировали мощные барьеры нейтрализации чужеродных ДНК. С помощью специальных ферментов — неспецифических нуклеаз — они расщепляют их на небольшие, нефункциональные фрагменты, которые являются исходным материалом синтеза функциональных молекул уже для собственных нужд. В мощном пуле потребляемой человеком чужеродной ДНК доля поступившего с пищей трансгена ничтожно мала: все равно что в ведро воды добавить еще одну каплю. Перед тем, как выпустить ГМО на рынок, их обязательно тщательно тестируют по многим параметрам — на аллергенность, мутагенность, канцерогенность и т. п. Во всех разрешенных случаях их применения встроенные гены кодируют только безопасные для здоровья человека белки. При малейших отклонениях от нормы генетически модифицированные организмы к использованию не допускаются. Поэтому крайне трудно представить, какие «катастрофические последствия» для нашего организма может вызвать потребление ГМО — пока в научной литературе такие факты отсутствуют.
Несомненно, мы не до конца знаем механизмы «утилизации» и последствия попадания чужеродной ДНК в клетки желудочно-кишечного тракта человека и животных. Но это скорее общая проблема нашего сосуществования с огромным пулом чужеродных ДНК сотен видов растений, животных и микроорганизмов. Проблема, которая возникла не вчера, и отнюдь не в связи с появлением генно-инженерных технологий. Создание и использование трансгенных организмов просто стимулируют развитие исследований в этом направлении, но вовсе не меняют ситуацию качественно. Даже запрет на ГМО ни в коей мере не решит проблему «генетической» безопасности, и вопрос относительно генетически модифицированных организмов составляет в ней мизерную долю. Тем не менее, подчеркнем еще раз, изучать последствия введения чужеродной ДНК в организм человека с пищей крайне необходимо еще и потому, что это позволит совершенствовать систему тестирования на безопасность ингредиентов, полученных из трансгенных организмов.
Трансгенные растения
В наши дни объемы использования трансгенных растений человеком растут. Это связано с их улучшенными характеристиками, в том числе с высокой устойчивостью к заболеваниям и вредителям. Благодаря приданию трансгенным растениям устойчивости к насекомым-вредителям (например, картофеля — к колорадскому жуку) снимается необходимость использовать в целях защиты от вредителей химические средства, которые сами по себе являются опасными для организма человека и животных.
Что же касается последствий использования трансгенных растений и химических средств защиты… Без колебаний можно выбрать первое, поскольку отрицательные последствия в данном случае только предполагаются, а во втором — они реальны и доказаны. Но в любом случае безапелляционное «за» и «против» того или другого безусловно вредно для развития науки. Вместо этого необходимо тщательно изучать все последствия применения новых пищевых продуктов, лекарств, материалов, химических средств, что и делается во многих лабораториях мира. Это длительный, тяжелый и дорогостоящий процесс, которому не следует мешать. Более того, он уже необратим, так как получаемая на многих миллионах гектаров сельскохозяйственная трансгенная продукция уже входит в виде отдельных ингредиентов во множество потребляемых людьми продуктов.
ГМО и утечка трансгенов
Бессмысленно, да и невозможно в биологии и сельском хозяйстве затормозить «технологический прогресс», под которым подразумевается селекция на основе генно-инженерных технологий. Поскольку, как уже говорилось, все трансгенные продукты проходят тщательное тестирование, основная проблема ГМО заключается вовсе не в опасности их использования в питании человека и животных. Более серьезные вещи, касающиеся биобезопасности, заключаются в другом. В.К. Шумный выделяет две основные проблемы, обычно выпадающие из внимания широкой общественности и СМИ. Первая — возможная утечка трансгенов к диким сородичам и последующее нарушение равновесия в природных сообществах; вторая касается взаимоотношений между вредителем и хозяином.
Что касается утечки трансгенов к диким видам, то ее вероятность пока скорее гипотетическая, чем реальная. Например, в эксперименте степень естественной гибридизации культурных и диких видов сои, которая является самоопыляющимся растением, даже при искусственном нанесении пыльцы получены лишь единичные семена, причем в выращенных из них растениях «работающих» трансгенов не было обнаружено. Тем не менее этот вопрос заслуживает серьезного изучения. Более того, в ряде случаев, очевидно, необходимо вводить технологии изолированного выращивания трансгенных форм, что будет определяться функциональной природой трансгенеза и видом растения.
Коэволюция
Следующий, более сложный вопрос, — коэволюция (то есть современная эволюция) паразита и хозяина. В этом случае, когда создаются устойчивые к вредителям формы трансгенных растений, в популяциях вредителей, естественно, также будет идти отбор на более устойчивые формы (например, к растительным токсинам). В результате порог устойчивости у вредителей повышается, что может свести на нет усилия селекционеров. В таких условиях нужно просто менять стратегию борьбы с вредителями путем введения новых агентов воздействия.
Очевидно, существуют и другие проблемы использования трансгенных растений, но в любом случае все они, без сомнения, нуждаются в тщательной научной проработке.
Процесс создания и использования ГМО уже не может быть остановлен, хотим мы этого или нет. У человечества на планете Земля уже нет шансов справиться с продовольственной проблемой при современной демографической ситуации. Еще в XVIII веке Т.Р. Мальтус (1798 г.) утверждал, что рост народонаселения происходит в геометрической прогрессии, а прирост средств к существованию — в арифметической. Сегодня мы стоим перед дилеммой: выживет или не выживет человечество из-за недостатка продуктов питания. От голода в мире ежегодно умирают десятки миллионов людей.
«Питательная» геномика
Особое развитие в последнее время получила так называемая «питательная» геномика, занимающаяся вопросами составления сбалансированных рационов питания. Учеными- диетологами разработаны точные рекомендации, в которых указывается, во сколько раз нужно увеличить потребление того или иного микроэлемента или витамина, чтобы понизить риск онкологических, сердечно-сосудистых, респираторных и многих других заболеваний. Среди населения резко повысились требования к потреблению здоровой пищи, содержащей все необходимые ингредиенты в достаточном, но не в избыточном количестве и одновременно не содержащей токсических компонентов. Многие сельскохозяйственные культуры, а также получаемые из них продукты, не содержат необходимые для человека аминокислоты, витамины, гормоны, микроэлементы. С другой стороны, в этих продуктах могут содержаться вещества, вредные и опасные для здоровья человека. В этой связи особое значение приобретает изучение геномов сельскохозяйственных растений, их биохимический состав, прямо зависящий от набора и структуры генов.
Биотехнология переноса генов
На одно из первых мест в этом направлении выдвигаются работы по биотехнологии переноса генов и конструирование на этой базе растений и животных с заранее определенной питательной ценностью. При этом уже сегодня в производственные сорта сельскохозяйственных продуцентов вводятся гены от видов, пригодных к использованию в качестве пищи. И, наоборот, из растений, не используемых в пищевом рационе сельскохозяйственных животных, удаляются гены, контролирующие образование тех токсических соединений, которые определяют их пищевую непригодность. Только на первый взгляд кажется, что в таком подходе нет ничего опасного, поскольку в организм при поедании поступают не искусственно синтезируемые, а природные вещества, к которым человек давно адаптировался в ходе эволюционного процесса. Однако эффективность производства генно-инженерных продуктов зависит, в первую очередь, от пищевых потребностей организма, а также от метаболизма веществ в организме. Кроме того, нельзя не учитывать характер метаболизма тех видов растительных и животных организмов, которые используются для производства продуктов питания.
В связи со всем сказанным становится понятно, что на многие вопросы в данной области пока не удалось получить достаточно четких ответов, а к генноинженерному конструированию сортов растений и животных, обладающих заданной питательной ценностью, следует пока относиться с большой осторожностью.
Литература
1. Глазер В.М. Генетическая рекомбинация без гомологии: процессы, ведущие к перестройкам в геноме//Soros Educational journal. — 1998, NJ. —P. 22.
2. Гвоздев В. А. Подвижная ДНК // Soros Educational Journal. — 1998, N8.-P. 15.
3. Корочкин Л.И. Клонирование животных // Soros Educ.
Journal. -1999, N4--P. 10.
4. Баранов М.В.С. Генная терапия — медицина XXI века //Soros Educational Journal. — 1999, N 3. —P. 63.
5. ГорбуноваВ.Н. Что вызнаете о своем геноме. — СПб., 2001.
6. Шумный В.К. Проблемы генетики растений // Информационный вестник ВОГиС, Новосибирск. — 2004. —Т. 8, №2. — С. 32-39.
7. Шестиков СВ. Трансгенные родственники // Наука из первых рук. — 2004, № 2. — С. 27-32.
8. Шумный В.К. Природа была первым, генным инженером // Наука из первых рук. — 2004, № 2. — С. 33-39